Skip to main content

Molekulare Bioinformatik — Informationsfusion zur Genregulation

  • Conference paper
Informatik’99

Part of the book series: Informatik aktuell ((INFORMAT))

  • 80 Accesses

Zusammenfassung

Die Methoden der Bioinformatik haben zum Ziel unbekannte, große genomische Datenmengen auf ihre Funktion hin zu analysieren. Da dies unter Nutzung bekannter genomischer Datenmengen geschieht, können Methoden der Bioinformatik im weiteren Sinne als algorithmische Fusion verschiedener Informationsquellen verstanden werden. Beispielhaft wird unter dieser Sichtweise ein neues Verfahren vorgestellt, das Genschaltersequenzen in DNA identifiziert, ohne vorher eine Modellrepräsentation dieser zu bilden. Statt dessen werden hochspezifische Modelle der Genschaltersequenzen erst in Zusammenhang mit der zu analysierenden Sequenz gebildet. Das vorgestellte Verfahren ist das derzeit einzige, das Modelle von Genschaltersequenzen selbständig und anwendungsbezogen aus entsprechenden Informationsquellen erzeugt und somit die Vorhersagemethode als Prozeß der Informationsfusion begreift. Das Verfahren wurde implementiert und ist über obige WWW-Adresse als AliBaba2 verfügbar.1

This is a preview of subscription content, log in via an institution to check access.

Access this chapter

Chapter
USD 29.95
Price excludes VAT (USA)
  • Available as PDF
  • Read on any device
  • Instant download
  • Own it forever
eBook
USD 44.99
Price excludes VAT (USA)
  • Available as PDF
  • Read on any device
  • Instant download
  • Own it forever
Softcover Book
USD 59.99
Price excludes VAT (USA)
  • Compact, lightweight edition
  • Dispatched in 3 to 5 business days
  • Free shipping worldwide - see info

Tax calculation will be finalised at checkout

Purchases are for personal use only

Institutional subscriptions

Preview

Unable to display preview. Download preview PDF.

Unable to display preview. Download preview PDF.

Literatur

  1. Heinemeyer, T., et al., Databases on transcriptional regulation: TRANSFAC, TRRD and COMPEL. Nucleic Acids Res., 1998. 26: p. 362–367.

    Article  Google Scholar 

  2. Quandt, K., et al., Matlnd and Matinspector: new fast and versatile tools for detection of consensus matches in nucleotide sequence data. Nucleic Acids Res., 1995. 23: p. 4878–4884.

    Article  Google Scholar 

  3. Chen, Q.K., G.Z. Hetz, and G.D. Stormo, Matrix-Search 1.0: A computer program that scans DNA sequences for transcriptional elements using a database of weight matrices. Comput. Applic. Biosci., 1995. 11: p. 563–566.

    Google Scholar 

  4. Akiyama, Y., TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites. 1995.

    Google Scholar 

  5. Schug, J. and G.C. Overton, TESS: Transcription Element Search Software on the WWW,. 1997, Computational Biology and Informatics Laboratory School of Medicine University of Pennsylvania.

    Google Scholar 

  6. Shannon, C.E., A mathematical theory of communicatin. Bell Syst. Tech., 1948. 27: p. 379–423 and 623–656.

    Google Scholar 

  7. Berg, O.G. and P.H. von Hippel, Selection of DNA binding sites by regulatory proteins. Statistical-mechanical theory and application to operators and promoters. J.Mol.Biol., 1987. 193: p. 723–750.

    Article  Google Scholar 

Download references

Author information

Authors and Affiliations

Authors

Editor information

Editors and Affiliations

Rights and permissions

Reprints and permissions

Copyright information

© 1999 Springer-Verlag Berlin Heidelberg

About this paper

Cite this paper

Grabe, N. (1999). Molekulare Bioinformatik — Informationsfusion zur Genregulation. In: Beiersdörfer, K., Engels, G., Schäfer, W. (eds) Informatik’99. Informatik aktuell. Springer, Berlin, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/978-3-662-01069-3_27

Download citation

  • DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-662-01069-3_27

  • Publisher Name: Springer, Berlin, Heidelberg

  • Print ISBN: 978-3-540-66450-5

  • Online ISBN: 978-3-662-01069-3

  • eBook Packages: Springer Book Archive

Publish with us

Policies and ethics